През сезон 2013/14 Созопол завършва на 1-во място в Югоизточната „В“ група и за първи път в своята история печели промоция за „Б“ група.[1] В първия си сезон във втора дивизия отборът финишира на 6-о място в крайното класиране, а през следващите две кампании завършва на 4-та позиция, като достига и 1/4 финал за Купата на страната, губейки на стадион „Българска армия“ от ЦСКА с 3:0, а попаденията падат в последните 10 минути на мача. През сезон 2017/2018 Созопол изпада в Трета лига, като записва и пълна успеваемост в срещите у дома, печелейки 17 победи от 17 мача и завършва на 2-ро място, на 5 точки от лидера Нефтохимик, който печели директна промоция при професионалистите. Созопол трябваше да бъде поканен във Втора лига, след като фалиралия Верея Стара Загора бе пратен при аматьорите, но БФС реши, че групата ще бъде съставена от нечетен брой – 17 тима и така небесносините трябваше да чакат още един сезон, за да се завърнат в елита. През сезон 2019 – 2020, Созопол е най-добрият отбор в групата, като печели срещу всички свои конкуренти. Лидерът има и най-малко допуснати попадения, едва 8 – 3 от дузпи, а след 11 месеца и половина без поражение в първенството, Созопол губи в два последователни мача – гостуванията на Борислав Първомай и Гигант Съединение, след което набира скорост и печели 6 последователни победи и реми. За жалост шампионатът е спрян заради пандемията от COVID 19, а БФС взима правилното решение – първенството да не бъде довършено, а да се вземе за крайно класиране временното. Созопол има преднина от 4 точки пред Марица Пловдив, 9 пред Черноморец Бургас и 2 или 5 пред Загорец Нова Загора, които взимат служебна победа от преустановилия участие ФК Хасково 1957 кръг преди да бъде спрян шампионата. След два сезона при аматьорите, Созопол отново ще се състезава във Втора лига.
ФК Созопол играе домакинските си мачове на „Арена Созопол“, който има европейски лиценз категория 3. Стадионът разполага с електрическо осветление и е с капацитет 4000 места.[2] Снабден е с модерна озвучителна система.[3] Изграждането на настоящото съоръжение започва в началото на 2010 г. и преминава в три етапа за три години.[4] Стадионът има две трибуни – „Северна“ и „Южна“, които са с капацитет от 2000 и 2000 места. Трибуните са изцяло покрити с козирки. Под едната трибуна са разположени 18 магазина, билетен център, кафене и сладкарница. Стадионът разполага с два паркинга за общо 300 автомобила. „Арена Созопол“ приема мачове от Европейското първенство за юноши до 17 години през 2015 г.